RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 AMPD3Q01432 767 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 GPBP1Q86WP2 473 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 DDX12PQ92771 950 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 MSCO60682 206 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 MTFR1Q15390 333 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.147e-7■■■■□ 21.4
PPARG-202ENST00000309576 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 XKR9Q5GH70 373 aa22.16■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 GNASQ5JWF2 1037 aa22.16■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 PADI6Q6TGC4 694 aa22.16■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 FAM167AQ96KS9 214 aa22.16■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 SPC25Q9HBM1 224 aa22.16■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.16■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 KLRC4O43908 158 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 DYMQ7RTS9 669 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 CEP170P1Q96L14 293 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 KCND2Q9NZV8 630 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 SYCE3A1L190 88 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 HAS3O00219 553 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 GIT2Q14161 759 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PPARG-202ENST00000309576 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 HBP1O60381 514 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 MYL3P08590 195 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 GUCY2CP25092 1073 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 MTERF2Q49AM1 385 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 ZNF333Q96JL9 665 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 REEP2Q9BRK0 252 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 KPNA6O60684 536 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 CCL5P13501 91 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 LRRC41Q15345 812 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 SMARCE1Q969G3 411 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 ARMC5Q96C12 935 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 GSDMAQ96QA5 445 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 TRPC6Q9Y210 931 aa22.13■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 SMC2O95347 1197 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 INSRRP14616 1297 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 ASIC1P78348 528 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 EHHADHQ08426 723 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 MAPK7Q13164 816 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 KCNA10Q16322 511 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 DAW1Q8N136 415 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 POLD4Q9HCU8 107 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.12■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 DGAT1O75907 488 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 BMP6P22004 513 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 RNF180Q86T96 592 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 PPME1Q9Y570 386 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 ASGR1P07306 291 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 RSPH10BP0C881 870 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 PSEN2P49810 448 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 KCNB1Q14721 858 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 MFSD10Q14728 455 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 UNC13DQ70J99 1090 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 RNF208Q9H0X6 261 aa22.11■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 BIN1O00499 593 aa22.1■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 ZEB2O60315 1214 aa22.1■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 ZNF131P52739 623 aa22.1■■□□□ 1.13
PPARG-202ENST00000309576 DEFB118Q96PH6 123 aa22.1■■□□□ 1.13
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