RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 CAP1Q01518 475 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM26FQ5R3K3 315 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL10Q6JEL2 608 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP170P1Q96L14 293 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 NRBP1Q9UHY1 535 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH11P35749 1972 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SMTNL1A8MU46 457 aa22.99■■□□□ 1.27
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PACSIN3-201ENST00000298838 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 GAP43P17677 238 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R2P41236 205 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PRCPP42785 496 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 MYL5Q02045 173 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ADSSL1Q8N142 457 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIB2Q92519 343 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 HPS3Q969F9 1004 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM167AQ96KS9 214 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM13AO94988 1023 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPA6P17066 643 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP4AP20648 1035 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC26A2P50443 739 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 AFG1LQ8WV93 481 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ERO1AQ96HE7 468 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TIPINQ9BVW5 301 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SRRDQ9UH36 339 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.98■■□□□ 1.27
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PACSIN3-201ENST00000298838 GNRH1P01148 92 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 RSPH10BP0C881 870 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM50Q86XT4 487 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PARVGQ9HBI0 331 aa22.98■■□□□ 1.27
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PACSIN3-201ENST00000298838 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMA7O14818 248 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TPM4P67936 248 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PAK1Q13153 545 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SFR1Q86XK3 245 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 FKTNO75072 461 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 HIP1RO75146 1068 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PPFIA4O75335 1185 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 DGAT1O75907 488 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF131P52739 623 aa22.96■■□□□ 1.27
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PACSIN3-201ENST00000298838 MTERF2Q49AM1 385 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 AKR1A1P14550 325 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 NCAPHQ15003 741 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TLK2Q86UE8 772 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 NELFBQ8WX92 580 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 DRC1Q96MC2 740 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-201ENST00000298838 LGALS2P05162 132 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 MAPK7Q13164 816 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 MYCT1Q8N699 235 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 POLD4Q9HCU8 107 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 SFI1A8K8P3 1242 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 MMP3P08254 477 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 CYBAP13498 195 aa22.94■■□□□ 1.26
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PACSIN3-201ENST00000298838 STX17P56962 302 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 DAW1Q8N136 415 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 Q9Y3F1 56 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-201ENST00000298838 PPME1Q9Y570 386 aa22.94■■□□□ 1.26
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