RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.04■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.04■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 MAGEB2O15479 319 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 GHRP10912 638 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 KCNJ6P48051 423 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 IKBKEQ14164 716 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 NBR1Q14596 966 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 Q7L0L9 218 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 METTL13Q8N6R0 699 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 SNX21Q969T3 373 aa28.03■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM150BA6NC51 233 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 MTERF2Q49AM1 385 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 SEPT8Q92599 483 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 DYDC2Q96IM9 177 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 TRPV2Q9Y5S1 764 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 MICAL3Q7RTP6 2002 aa28.02■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 PTPRSQ13332 1948 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 OR52Z1P0C646 297 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 DNAJB2P25686 324 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 PBX2P40425 430 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 WDR5P61964 334 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 DEFB123Q8N688 67 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 SLC9A7Q96T83 725 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 LXNQ9BS40 222 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 PBX4Q9BYU1 374 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 RGL1Q9NZL6 768 aa28.01■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 EFCAB14O75071 495 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 CLCN3P51790 818 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 CYP4A11Q02928 519 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 LPIN1Q14693 890 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 FBXO47Q5MNV8 452 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF697Q5TEC3 545 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 ANO5Q75V66 913 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 SH2D3AQ9BRG2 576 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 SLITRK3O94933 977 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 PDCP20941 246 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 RABGGTBP53611 331 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 PLA2G4FQ68DD2 849 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 EFCAB12Q6NXP0 572 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 C4orf19Q8IY42 314 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC71Q8N4P6 559 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 C4orf32Q8N8J7 132 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 HSD17B14Q9BPX1 270 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 MSRAQ9UJ68 235 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa27.99■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 POTEMA6NI47 508 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 TMOD1P28289 359 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 DEFB103AP81534 67 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 RAB30Q15771 203 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 RILPL1Q5EBL4 403 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 TPH2Q8IWU9 490 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 APBB2Q92870 758 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 TIFAQ96CG3 184 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 FAM161BQ96MY7 647 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 CEP89Q96ST8 783 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R16BQ96T49 567 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 SUGCTQ9HAC7 445 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 GINS2Q9Y248 185 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 SQORQ9Y6N5 450 aa27.98■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa27.97■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 VTNP04004 478 aa27.97■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 TECP42680 631 aa27.97■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 LINC01465Q8N7H1 131 aa27.97■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 USP38Q8NB14 1042 aa27.97■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 NEK9Q8TD19 979 aa27.97■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 MAP7D2Q96T17 732 aa27.97■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 AKT3Q9Y243 479 aa27.97■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 YWHABP31946 246 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 PTGDRQ13258 359 aa27.96■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 HERC6Q8IVU3 1022 aa27.96■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 HSCBQ8IWL3 235 aa27.96■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 CYP26B1Q9NR63 512 aa27.96■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CXCL2-201ENST00000296031 SLC34A2O95436 690 aa27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 CD52P31358 61 aa27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 NPEPPSP55786 919 aa27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 KIZQ2M2Z5 673 aa27.95■■■□□ 2.06
CXCL2-201ENST00000296031 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms