RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278544.9

ACER3-201, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 3,500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-201ENST00000278544 DRP2Q13474 957 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 TTLL4Q14679 1199 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 MAPK4P31152 587 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 BEX3Q00994 111 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 METTL13Q8N6R0 699 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 AZI2Q9H6S1 392 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.73□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 VEGFBP49765 207 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 SPATA1Q5VX52 437 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 DAW1Q8N136 415 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 P2RX5Q93086 422 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 PCYT2Q99447 389 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 UNCXA6NJT0 531 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 ASB14A6NK59 587 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 K7ENM7 598 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 GRB14Q14449 540 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 NEDD9Q14511 834 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 PARVGQ9HBI0 331 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 STRNO43815 780 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 FLT3LGP49771 235 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 ACVR2BQ13705 512 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 KCNB1Q14721 858 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 SCFD2Q8WU76 684 aa14.72□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 B4DLN1 442 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 MAFGO15525 162 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 SMPD1P17405 629 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 SFNP31947 248 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 CEP135Q66GS9 1140 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 METTL7BQ6UX53 244 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 N4BP3O15049 544 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 CAVIN2O95810 425 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 CYP2J2P51589 502 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 PRKCZQ05513 592 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 NOGQ13253 232 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.71□□□□□ -0.05
ACER3-201ENST00000278544 KCNJ18B7U540 433 aa14.71□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 APLP1P51693 650 aa14.71□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 MAP2K5Q13163 448 aa14.71□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 KCNJ12Q14500 433 aa14.71□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 FAM84AQ96KN4 292 aa14.71□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.71□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.71□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.71□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 IKBKBO14920 756 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 CA12O43570 354 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 BSNDQ8WZ55 320 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 GPR20Q99678 358 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 COPB2P35606 906 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 KRT31Q15323 416 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 TTI2Q6NXR4 508 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 INTS13Q9NVM9 706 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 CCNE1P24864 410 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 C4orf19Q8IY42 314 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.7□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.69□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.69□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.69□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.69□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.69□□□□□ -0.06
ACER3-201ENST00000278544 CASP4P49662 377 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms