RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 WDR44Q5JSH3 913 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 CHMP2AO43633 222 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ATP1A3P13637 1013 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 FECHP22830 423 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 ASIC2Q16515 512 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 POTEDQ86YR6 584 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 TPH2Q8IWU9 490 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPN3-201ENST00000262539 DAPK3O43293 454 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 TMOD1P28289 359 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC14Q49A88 953 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 DYMQ7RTS9 669 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 NFASCO94856 1347 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC151A5D8V7 595 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 FZD9O00144 591 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 PRCPP42785 496 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 POTEAQ6S8J7 498 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 USP49Q70CQ1 688 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 TXNDC16Q9P2K2 825 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 HYOU1Q9Y4L1 999 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 FAM205CA6NFA0 338 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 DSG3P32926 999 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 PLCB3Q01970 1234 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 XKR9Q5GH70 373 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 PADI6Q6TGC4 694 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 DNAJC7Q99615 494 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 JADE2Q9NQC1 790 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 CASP14P31944 242 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 RNF169Q8NCN4 708 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 DEPTORQ8TB45 409 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 MAGEB2O15479 319 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 TMC2Q8TDI7 906 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 FNBP1Q96RU3 617 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 GDAQ9Y2T3 454 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 POTEMA6NI47 508 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 NDUFA10O95299 355 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 GCNT3O95395 438 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 SERPING1P05155 500 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 GTF2H1P32780 548 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 PTGER2P43116 358 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 HSD17B4P51659 736 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 CACNB3P54284 484 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 CCZ1BP86790 482 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC169A6NNP5 214 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 PMM2O15305 246 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 UBE2SQ16763 222 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM51Q9NW97 253 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 HACL1Q9UJ83 578 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 STRNO43815 780 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 PRLRP16471 622 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPN3-201ENST00000262539 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms