RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
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TOMM40-201ENST00000252487 ASIC1P78348 528 aa29.05■■■□□ 2.24
TOMM40-201ENST00000252487 PADI6Q6TGC4 694 aa29.05■■■□□ 2.24
TOMM40-201ENST00000252487 KCTD17Q8N5Z5 321 aa29.05■■■□□ 2.24
TOMM40-201ENST00000252487 CEP170P1Q96L14 293 aa29.05■■■□□ 2.24
TOMM40-201ENST00000252487 ANKEF1Q9NU02 776 aa29.05■■■□□ 2.24
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TOMM40-201ENST00000252487 C1orf186Q6ZWK4 172 aa29.03■■■□□ 2.24
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TOMM40-201ENST00000252487 OTUD6AQ7L8S5 288 aa29.03■■■□□ 2.24
TOMM40-201ENST00000252487 ATP8B4Q8TF62 1192 aa29.03■■■□□ 2.24
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TOMM40-201ENST00000252487 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.03■■■□□ 2.24
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TOMM40-201ENST00000252487 RSPH10BP0C881 870 aa29.02■■■□□ 2.24
TOMM40-201ENST00000252487 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.245e-8■■■□□ 18
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TOMM40-201ENST00000252487 SPC25Q9HBM1 224 aa29.01■■■□□ 2.23
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TOMM40-201ENST00000252487 SOX10P56693 466 aa29■■■□□ 2.23
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TOMM40-201ENST00000252487 HPS3Q969F9 1004 aa29■■■□□ 2.23
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TOMM40-201ENST00000252487 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.99■■■□□ 2.23
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TOMM40-201ENST00000252487 SFI1A8K8P3 1242 aa28.98■■■□□ 2.23
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TOMM40-201ENST00000252487 MYH11P35749 1972 aa28.97■■■□□ 2.23
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TOMM40-201ENST00000252487 LRRC41Q15345 812 aa28.96■■■□□ 2.23
TOMM40-201ENST00000252487 UNC13DQ70J99 1090 aa28.96■■■□□ 2.23
TOMM40-201ENST00000252487 GSDMAQ96QA5 445 aa28.96■■■□□ 2.23
TOMM40-201ENST00000252487 TBC1D7Q9P0N9 293 aa28.96■■■□□ 2.23
TOMM40-201ENST00000252487 MSCO60682 206 aa28.95■■■□□ 2.23
TOMM40-201ENST00000252487 GUCY2CP25092 1073 aa28.95■■■□□ 2.23
TOMM40-201ENST00000252487 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
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