RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcaf8Q8N7N5 591 aa18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zkscan3Q91VW9 553 aa18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rasgef1cQ9D300 466 aa18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf354cQ571J5 560 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp2b4Q6Q477 1205 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ms4a5Q810P8 197 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SucoQ8C341 1250 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr72D3YYM4 1114 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scgb2b7D3YYY1 112 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2afzP0C0S6 128 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2afvQ3THW5 128 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scarf1Q5ND28 820 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CrkQ64010 304 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 IarsQ8BU30 1262 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 WdpcpQ8C456 722 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Enox2Q8R0Z2 598 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nup58Q8R332 587 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cbwd1Q8VEH6 393 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ArpinQ9D0A3 226 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 3830403N18RikQ9D6C3 208 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MefvQ9JJ26 767 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp31E9Q6Y8 1344 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gdap1O88741 358 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Siah1bQ06985 282 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tsga10Q6NY15 697 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pja2Q80U04 707 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psmd5Q8BJY1 504 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Calml4Q91WQ9 153 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 IvdQ9JHI5 424 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cul1Q9WTX6 776 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp174B9EJW5 407 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp213E9QAW0 468 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgs9bpQ148R9 237 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tspyl5Q69ZB3 406 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbed4Q80WQ9 1168 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Riox2Q8CD15 465 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pstpip2Q99M15 334 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Flvcr1B2RXV4 560 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 InhbeO08717 350 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clcn6O35454 870 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HelqQ2VPA6 1069 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clul1Q3ZRW6 464 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klra5Q60652 266 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Foxo6Q70KY4 559 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DcakdQ8BHC4 231 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc134Q8C7V8 229 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Coa7Q921H9 231 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mageb16Q9CWV4 363 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnip1Q9WUU8 647 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kmt2eQ3UG20 1868 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim55G3X8Y1 545 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CraddO88843 199 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmod1P49813 359 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mmp14P53690 582 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xxylt1Q3U4G3 392 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RpainQ9CWY9 219 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Azi2Q9QYP6 405 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eya4Q9Z191 616 aa18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnaseh1O70338 285 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DtnbO70585 659 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ctnna1P26231 906 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 OatP29758 439 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pkn1P70268 946 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gja5Q01231 358 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tatdn3Q3U1C6 294 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dph1Q5NCQ5 438 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lilrb4Q64281 335 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fermt3Q8K1B8 665 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tut1Q8R3F9 869 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc12a6Q924N4 1150 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klc4Q9DBS5 619 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mybl2P48972 704 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BC051142Q3V0M8 400 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd13dQ6PD24 605 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc16Q8C1F5 767 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CrygnQ8VHL5 183 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Anapc4Q91W96 807 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcf2Q99LE6 628 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4930550L24RikQ99PA7 320 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cse1lQ9ERK4 971 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc13A0A1L1SSC7 844 aa18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ace3D0G895 737 aa18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gsg1l2M0QWL6 290 aa18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tp53P02340 387 aa18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.4 ms