RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 IQCEQ6IPM2 695 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.36■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 RPTORQ8N122 1335 aa20.36■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 ZNF263O14978 683 aa20.36■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 NOL4O94818 638 aa20.36■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.36■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 HOOK2Q96ED9 719 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.36■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 RSPH10BP0C881 870 aa20.35■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 MCM3P25205 808 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 POLD1P28340 1107 aa20.35■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 UBXN2AP68543 259 aa20.35■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.35■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 HGSNATQ68CP4 663 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 EPC1Q9H2F5 836 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 TFR2Q9UP52 801 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 ASTN1O14525 1302 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 ZNF536O15090 1300 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.34■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 GUCY2CP25092 1073 aa20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 ZNF131P52739 623 aa20.34■□□□□ 0.85
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CLN8-211ENST00000636934 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CLN8-211ENST00000636934 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
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CLN8-211ENST00000636934 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.33■□□□□ 0.84
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CLN8-211ENST00000636934 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.33■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.33■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.33■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 ZBED4O75132 1171 aa20.32■□□□□ 0.84
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CLN8-211ENST00000636934 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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CLN8-211ENST00000636934 CAGE1Q8TC20 777 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 NOX5Q96PH1 765 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 LXNQ9BS40 222 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 TSKSQ9UJT2 592 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.32■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 AKAP3O75969 853 aa20.31■□□□□ 0.84
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CLN8-211ENST00000636934 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 ALAS1P13196 640 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 ALCAMQ13740 583 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN8-211ENST00000636934 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.31■□□□□ 0.84
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