RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF318Q5VUA4 2279 aa27.45■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 NID2Q14112 1375 aa27.45■■□□□ 1.99
CAPNS1-216ENST00000628306 RB1P06400 928 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SYT1P21579 422 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 STK3Q13188 491 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 APOA5Q6Q788 366 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ADHFE1Q8IWW8 467 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 STX6O43752 255 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGB5P18084 799 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO47Q5MNV8 452 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF2Q6P1X5 1199 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K14Q99558 947 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MYL10Q9BUA6 226 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 LMAN2LQ9H0V9 348 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC69A6NI79 296 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 PTMSP20962 102 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MCM4P33991 863 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.982e-11■■■□□ 17.4
CAPNS1-216ENST00000628306 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 GPRASP2Q96D09 838 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB43O43298 467 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 IRS1P35568 1242 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 PPFIA1Q13136 1202 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 PKP1Q13835 747 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 EP400NLQ6ZTU2 488 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB10Q96DT7 871 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX10O75333 385 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 DGKIO75912 1065 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHA8P1O95397 391 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CTDNEP1O95476 244 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCA1P28370 1054 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIK4Q16099 956 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF654Q8IZM8 581 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB3Q8WWF6 145 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 PCYT2Q99447 389 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1671Q9BY89 1806 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MBTPS2O43462 519 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 NCK2O43639 380 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKL5O76039 1030 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MARK3P27448 753 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRX1Q86UT6 975 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBE1Q9UJT0 475 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CDY2AQ9Y6F7 541 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01565O15544 149 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 DDAH1O94760 285 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP1P03956 469 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CALM1P0DP23 149 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CALM2P0DP24 149 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CALM3P0DP25 149 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB1P25685 340 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.984e-11■□□□□ 10.1
CAPNS1-216ENST00000628306 CCT2P78371 535 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CLUL1Q15846 466 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM50BQ9Y247 325 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 RWDD3Q9Y3V2 267 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TECTAO75443 2155 aa27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 CUL5Q93034 780 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 UIMC1Q96RL1 719 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 ERAP1Q9NZ08 941 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 CPLX1O14810 134 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 PLAGL2Q9UPG8 496 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 MTMR6Q9Y217 621 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 CD52P31358 61 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM15Q13444 863 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2SQ16763 222 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 HFE2Q6ZVN8 426 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-216ENST00000628306 MSLNLQ96KJ4 702 aa27.36■■□□□ 1.97
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