RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622939.3

CU633967.1-209, humanhuman

TSL 3

Gene CU633967.1, Length 589 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-209ENST00000622939 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.4□□□□□ -1.06
CU633967.1-209ENST00000622939 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CU633967.1-209ENST00000622939 C6orf50Q9HD87 102 aa8.4□□□□□ -1.06
CU633967.1-209ENST00000622939 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.4□□□□□ -1.06
CU633967.1-209ENST00000622939 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.4□□□□□ -1.06
CU633967.1-209ENST00000622939 PADI3Q9ULW8 664 aa8.4□□□□□ -1.06
CU633967.1-209ENST00000622939 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.4□□□□□ -1.06
CU633967.1-209ENST00000622939 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CU633967.1-209ENST00000622939 TRPV2Q9Y5S1 764 aa8.4□□□□□ -1.06
CU633967.1-209ENST00000622939 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.4□□□□□ -1.06
CU633967.1-209ENST00000622939 LAMA4Q16363 1823 aa8.4□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 FSD2A1L4K1 749 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 GPR182O15218 404 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 MAGEB2O15479 319 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 REC8O95072 547 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 LINC00271P0C7V0 271 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 KLRC1P26715 233 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 MARK3P27448 753 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 HSPA4P34932 840 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 KRT76Q01546 638 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 GJD3Q8N144 294 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 TRPC6Q9Y210 931 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 COL4A6Q14031 1691 aa8.39□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 FAM86B1E9PN63 330 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 CCNE2O96020 404 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 MMP1P03956 469 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PSAPP07602 524 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 IFNAR1P17181 557 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 KCNA5P22460 613 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 CDC27P30260 824 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 CD52P31358 61 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 FAM189BP81408 668 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 UBE3AQ05086 875 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PAK2Q13177 524 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 GALNT17Q6IS24 598 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 SWSAP1Q6NVH7 229 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 RIT2Q99578 217 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 ZNF302Q9NR11 478 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 AAASQ9NRG9 546 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 RGS18Q9NS28 235 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 NID2Q14112 1375 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 CARNS1A5YM72 827 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 BACH1O14867 736 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 RPS6KB1P23443 525 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 TMOD1P28289 359 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 SFNP31947 248 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 CTNNB1P35222 781 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 IGBP1P78318 339 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 NTRK3Q16288 839 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 PKN1Q16512 942 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 Q6ZUG5 572 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.37□□□□□ -1.07
CU633967.1-209ENST00000622939 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms