RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619252.4

CU633967.1-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU633967.1, Length 549 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-201ENST00000619252 NTRK3Q16288 839 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 FIBCD1Q8N539 461 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 NECAB1Q8N987 351 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 BANK1Q8NDB2 785 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 BICD2Q8TD16 824 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 IL17RAQ96F46 866 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 LMAN2LQ9H0V9 348 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 BCAS3Q9H6U6 928 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa11.31□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 MAFGO15525 162 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 PFKFB2O60825 505 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 GPR37L1O60883 481 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 RB1P06400 928 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 GHRP10912 638 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 XBP1P17861 261 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 AP3B2Q13367 1082 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 GRIK4Q16099 956 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 PKN1Q16512 942 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 NEK9Q8TD19 979 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 GLG1Q92896 1179 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 EPHX3Q9H6B9 360 aa11.3□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 C5orf67F2Z3F1 127 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 M0QZ92 97 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 ITGB5P18084 799 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 MGAT3Q09327 533 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 COL19A1Q14993 1142 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 ME3Q16798 604 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 TCEAL5Q5H9L2 206 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 RUFY4Q6ZNE9 571 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 GJD3Q8N144 294 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 AZI2Q9H6S1 392 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 WDR81Q562E7 1941 aa11.29□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 EVPLQ92817 2033 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 ESYT2A0FGR8 921 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 LARGE1O95461 756 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 CHRNA1P02708 482 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 ALADP13716 330 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 IL9P15248 144 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 MARK3P27448 753 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 LPIN1Q14693 890 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 FBXO47Q5MNV8 452 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 MCTP2Q6DN12 878 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC83Q8IWF9 413 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 WASF1Q92558 559 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 AIFM3Q96NN9 605 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 UIMC1Q96RL1 719 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 SDF4Q9BRK5 362 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 PLVAPQ9BX97 442 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 JADE2Q9NQC1 790 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 PRKAG3Q9UGI9 489 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 CDY2AQ9Y6F7 541 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 SQORQ9Y6N5 450 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 NFASCO94856 1347 aa11.28□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 H3BQ06 376 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 ST18O60284 1047 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 ATP9AO75110 1047 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 BMPR1AP36894 532 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 TRIM29Q14134 588 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 IER5Q5VY09 327 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 GTF3C6Q969F1 213 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 MXRA8Q9BRK3 442 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 SH3GLB2Q9NR46 395 aa11.27□□□□□ -0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 CLDND1Q9NY35 253 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms