RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 C5orf42Q9H799 3197 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa28.44■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 M0QZ92 97 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 STXBP3O00186 592 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB43O43298 467 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 POTEBQ6S5H4 581 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.43■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC26A2P50443 739 aa28.43■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 PRKAG3Q9UGI9 489 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.42■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 ALADP13716 330 aa28.42■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 AP3B2Q13367 1082 aa28.42■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.42■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 MTHFD1LQ6UB35 978 aa28.42■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.42■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 CAMK1Q14012 370 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 RASEFQ8IZ41 740 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 P2RX5Q93086 422 aa28.41■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 CCNE2O96020 404 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 KRT76Q01546 638 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 ABHD15Q6UXT9 468 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf67A6NJJ6 358 aa28.39■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 STAG3L1P0CL83 205 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 CDC27P30260 824 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF76P36508 570 aa28.39■■■□□ 2.14
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PTPRF-216ENST00000617451 KLRC1P26715 233 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
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PTPRF-216ENST00000617451 KRT32Q14532 448 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 CLUL1Q15846 466 aa28.36■■■□□ 2.13
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PTPRF-216ENST00000617451 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 LINC01565O15544 149 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 MBTPS2O43462 519 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 TBX10O75333 385 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 CYP3A4P08684 503 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM15Q13444 863 aa28.35■■■□□ 2.13
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