RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ECE1	P42892	770 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	ECM1	Q16610	540 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	SNX24	Q9Y343	169 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	GYS1	P13807	737 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	STAT2	P52630	851 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MYL7	Q01449	175 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ACSS3-208	ENST00000616449	AFF2	P51816	1311 aa		13.9	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PBX1	P40424	430 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP4C	P60510	307 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC15	Q8TF66	581 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	DAPK3	O43293	454 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PARVG	Q9HBI0	331 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CASP5	P51878	434 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SEC24C	P53992	1094 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ECE2	O60344	883 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP11B2	P19099	503 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMD2	Q13200	908 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	UCHL3	P15374	230 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PDE6B	P35913	854 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TNNI1	P19237	187 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	NR1D1	P20393	614 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PEX3	P56589	373 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TRADD	Q15628	312 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF263	O14978	683 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	RAD51C	O43502	376 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	COG2	Q14746	738 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	GLI1	P08151	1106 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	KAZN	Q674X7	775 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ZIM3	Q96PE6	472 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PRG0	241 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM153B	P0C7A2	387 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	NF2	P35240	595 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	RHBDL3	P58872	404 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM153C	Q494X1	144 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	TTI1	O43156	1089 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	BCR	P11274	1271 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ACSS3-208	ENST00000616449	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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