RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 POTEBQ6S5H4 581 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 SMARCE1Q969G3 411 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 GJA10Q969M2 543 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TRIM47Q96LD4 638 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 LXNQ9BS40 222 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TIPINQ9BVW5 301 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 Q9Y3F1 56 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 HTTP42858 3142 aa9.14□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 POTEFA5A3E0 1075 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 GPR25O00155 361 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CHMP2AO43633 222 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 LGR5O75473 907 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 ARIH2O95376 493 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 GGPS1O95749 300 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 GH1P01241 217 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CTGFP29279 349 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PPP1R2P41236 205 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 SLC12A3P55017 1021 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 STX1AQ16623 288 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 POTEGQ6S5H5 508 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 DYDC2Q96IM9 177 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 FAM167AQ96KS9 214 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TRIM9Q9C026 710 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 ANO10Q9NW15 660 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 DACH1Q9UI36 760 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 SAMM50Q9Y512 469 aa9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 FKTNO75072 461 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 RHOBTB3O94955 611 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TBC1D8O95759 1140 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PLA2G4BP0C869 781 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 NLRP12P59046 1061 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CYP4A11Q02928 519 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TYRO3Q06418 890 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 ARHGAP1Q07960 439 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PSMD2Q13200 908 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PNOCQ13519 176 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 ECM1Q16610 540 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 LY6KQ17RY6 165 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 KCNK18Q7Z418 384 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TPH2Q8IWU9 490 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 EXOC8Q8IYI6 725 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PPTC7Q8NI37 304 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 LRRC15Q8TF66 581 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 GPR20Q99678 358 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 MTRQ99707 1265 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PANK2Q9BZ23 570 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TSPY26PQ9H489 355 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 RGL1Q9NZL6 768 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 SRRDQ9UH36 339 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 E9PMD0 336 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CYBAP13498 195 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 AKR1A1P14550 325 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CYP11B2P19099 503 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 CYP2B6P20813 491 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 SCP2P22307 547 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 GUCY2CP25092 1073 aa9.11□□□□□ -0.95
KDM5B-210ENST00000602511 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 152.3 ms