RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLG1	Q92896	1179 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	AZI2	Q9H6S1	392 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	LYPLA2	O95372	231 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR29	P0C7W0	189 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP4A	P20648	1035 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAT5B	P51692	787 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	POSTN	Q15063	836 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	KANK3	Q6NY19	840 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		10.23	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576		A6NJR5	290 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPFIA4	O75335	1185 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MMP3	P08254	477 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRKCE	Q02156	737 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANO5	Q75V66	913 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SV2B	Q7L1I2	683 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q9Y3F1	56 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	LGR5	O75473	907 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	EYA4	O95677	639 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF286B	P0CG31	522 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	RARB	P10826	455 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MARK3	P27448	753 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC12A3	P55017	1021 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTAGE5	O15320	804 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	STBD1	O95210	358 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PGK1	P00558	417 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	LGALS2	P05162	132 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	BEX3	Q00994	111 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	CUL4B	Q13620	913 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	DGKD	Q16760	1214 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	EMSY	Q7Z589	1322 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYCE3	A1L190	88 aa		10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYMK	A6NI61	221 aa		10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPEPPS	P55786	919 aa		10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM9	Q9C026	710 aa		10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.21	□□□□□ -0.77
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYADML2	A6NDP7	307 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RARRES1	P49788	294 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CPT1A	P50416	773 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMPD3	Q01432	767 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	XKR3	Q5GH77	459 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPBP1	Q86WP2	473 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	OAT	P04181	439 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	10.2	□□□□□ -0.78	8e-6	■■□□□ 12.6
EFTUD2-223	ENST00000592576	GJA9	P57773	515 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DPYD	Q12882	1025 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARSH	Q5FYA8	562 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DYM	Q7RTS9	669 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX12P	Q92771	950 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP11B2	P19099	503 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	XKR9	Q5GH70	373 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPC25	Q9HBM1	224 aa		10.2	□□□□□ -0.78
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		10.2	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 235.4 ms