RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589222.5

BCAS3-222, Transcript of BCAS3, microtubule associated cell migration factor, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCAS3, Length 3,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCAS3-222	ENST00000589222	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	XKR9	Q5GH70	373 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	AKAP3	O75969	853 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	JAG1	P78504	1218 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	PDIA5	Q14554	519 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	MESD	Q14696	234 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	CALCA	P01258	141 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	SERPING1	P05155	500 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	AR	P10275	920 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	ADRA2B	P18089	450 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	PDCL	Q13371	301 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	TJP1	Q07157	1748 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	RASSF10	A6NK89	507 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	PEX3	P56589	373 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	NPEPPS	P55786	919 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	PROM2	Q8N271	834 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222		M0R2N6	131 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	CYP2C19	P33261	490 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	ABCC6	O95255	1503 aa		13.33	□□□□□ -0.27
BCAS3-222	ENST00000589222	LRP6	O75581	1613 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	SLC16A4	O15374	487 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	UCHL3	P15374	230 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	BIRC3	Q13489	604 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	IFT20	Q8IY31	132 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	PARVG	Q9HBI0	331 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	PSMD14	O00487	310 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	NDUFAB1	O14561	156 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	SPOP	O43791	374 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	NF2	P35240	595 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	CETN1	Q12798	172 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	AMACR	Q9UHK6	382 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	LXN	Q9BS40	222 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	MEIS2	O14770	477 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	SLCO1A2	P46721	670 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	LIG3	P49916	1009 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	TNNC1	P63316	161 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	SNX1	Q13596	522 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	CEP72	Q9P209	647 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	GIT2	Q14161	759 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	STIM2	Q9P246	746 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	ACTN2	P35609	894 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.31	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	PSMD2	Q13200	908 aa		13.31	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.31	□□□□□ -0.28
BCAS3-222	ENST00000589222	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.31	□□□□□ -0.28

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