RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 LRIT3Q3SXY7 679 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 KRT79Q5XKE5 535 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 PDXDC2PQ6P474 469 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 CXCL17Q6UXB2 119 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 CLEC17AQ6ZS10 378 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 TMEM87AQ8NBN3 555 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 BANK1Q8NDB2 785 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 BADQ92934 168 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 VTI1AQ96AJ9 217 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 DYDC2Q96IM9 177 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 GLT1D1Q96MS3 346 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 C16orf70Q9BSU1 422 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 KATNAL1Q9BW62 490 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 PCDHA7Q9UN72 937 aa12.16□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 POTEB3A0JP26 581 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 KIAA0355O15063 1070 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 SLC26A4O43511 780 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 CABYRO75952 493 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 P4HBP07237 508 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 CLTBP09497 229 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 UBA7P41226 1012 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 QARSP47897 775 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 SLC26A2P50443 739 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 STAT5BP51692 787 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 PRKCEQ02156 737 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 SWSAP1Q6NVH7 229 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 POTEBQ6S5H4 581 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 CABP7Q86V35 215 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 RASSF8Q8NHQ8 419 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 KAT2BQ92831 832 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 FAM167AQ96KS9 214 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 TOX2Q96NM4 488 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 HSD17B14Q9BPX1 270 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 TUFT1Q9NNX1 390 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 ERAP1Q9NZ08 941 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 RGL1Q9NZL6 768 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 WDR81Q562E7 1941 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-204ENST00000587769 SCN5AQ14524 2016 aa12.15□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 DCDC2CA8MYV0 355 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 H3BRB1 525 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 ARVCFO00192 962 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 ZNF862O60290 1169 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 MED24O75448 989 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 OATP04181 439 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 MUTP22033 750 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 MARK3P27448 753 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 RPA1P27694 616 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 CDC25AP30304 524 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 PSEN2P49810 448 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 MFSD10Q14728 455 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 SPECC1Q5M775 1068 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 ADALQ6DHV7 355 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 POTEGQ6S5H5 508 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 SHC4Q6S5L8 630 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 CKAP2LQ8IYA6 745 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 ATP8B4Q8TF62 1192 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 CCSER1Q9C0I3 900 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 TMEM39AQ9NV64 488 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 TET1Q8NFU7 2136 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 GBF1Q92538 1859 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 A0A1W2PQ27 194 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 A0A1W2PQ64 194 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 A0A1W2PQD8 194 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 HAS3O00219 553 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 SLITRK3O94933 977 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 LYPLA2O95372 231 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 PLCB4Q15147 1175 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 SHHQ15465 462 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 KIAA0753Q2KHM9 967 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 TMEM119Q4V9L6 283 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 HYIQ5T013 277 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 RESP18Q5W5W9 173 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 USP49Q70CQ1 688 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 CATSPER3Q86XQ3 398 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 TPH2Q8IWU9 490 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 C4orf19Q8IY42 314 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 CALML4Q96GE6 196 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 EPSTI1Q96J88 318 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-204ENST00000587769 NT5C3AQ9H0P0 336 aa12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms