RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580813.1

VNN3-214, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 5

Gene VNN3, Length 558 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-214ENST00000580813 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 CBLCQ9ULV8 474 aa7.39□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.39□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.39□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.39□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 WNT9AO14904 365 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 GJA4P35212 333 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 DNM2P50570 870 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 KCNQ1P51787 676 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 FIGNQ5HY92 759 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 AGBL4Q5VU57 503 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 SCYL1Q96KG9 808 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 OR14A2Q96R54 314 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 INCENPQ9NQS7 918 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 GALNT8Q9NY28 637 aa7.38□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 GSTA4O15217 222 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 HMGCRP04035 888 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 NAT1P18440 290 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 ETV4P43268 484 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 IL13RA1P78552 427 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 KLF10Q13118 480 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 FOXE3Q13461 319 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 RASGRF1Q13972 1273 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 WDR48Q8TAF3 677 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.37□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 CCDC66A2RUB6 948 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 ARVCFO00192 962 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 RAD17O75943 681 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 MC4RP32245 332 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 GABREP78334 506 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 EDAQ92838 391 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 CSRNP2Q9H175 543 aa7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 AOAHP28039 575 aa7.35□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 EXTL1Q92935 676 aa7.35□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.35□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.35□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 FBXO10Q9UK96 956 aa7.35□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 ARHGAP6O43182 974 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 CRTAMO95727 393 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 FAM153BP0C7A2 387 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 TBR1Q16650 682 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 EXOC2Q96KP1 924 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 MENTQ9BUN1 341 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 BTBD7Q9P203 1132 aa7.34□□□□□ -1.23
VNN3-214ENST00000580813 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 HERVK_113P62684 666 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 Q6ZSN1 163 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 USP30Q70CQ3 517 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 FAM89AQ96GI7 184 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 WNK4Q96J92 1243 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 BTBD2Q9BX70 525 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.33□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 MATN2O00339 956 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 SCDO00767 359 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 APPP05067 770 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 ECE1P42892 770 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 MEOX1P50221 254 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 CD83Q01151 205 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 PCOLCEQ15113 449 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 MIIPQ5JXC2 388 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 ZNF503Q96F45 646 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 AMNQ9BXJ7 453 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 OVOL3O00110 214 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 MMEP08473 750 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 ATP2B1P20020 1258 aa7.31□□□□□ -1.24
VNN3-214ENST00000580813 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms