RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	BEX3	Q00994	111 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	CYP4A11	Q02928	519 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	GRB10	Q13322	594 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	KCNA10	Q16322	511 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	XKR3	Q5GH77	459 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	STK17A	Q9UEE5	414 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		18.8	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	F2	P00734	622 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	MYL3	P08590	195 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	SYK	P43405	635 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	NDUFA8	P51970	172 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	PNMA5	Q96PV4	448 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	PPME1	Q9Y570	386 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	POTEB3	A0JP26	581 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	MYADML2	A6NDP7	307 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	DNM1L	O00429	736 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF862	O60290	1169 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	HBP1	O60381	514 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	PLCG1	P19174	1290 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	GJA8	P48165	433 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ECM1	Q16610	540 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	UGCG	Q16739	394 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	POTEB	Q6S5H4	581 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	KBTBD13	C9JR72	458 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	HAS3	O00219	553 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	STBD1	O95210	358 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	EYA4	O95677	639 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	OAT	P04181	439 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ASGR1	P07306	291 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ATP4A	P20648	1035 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	STAT6	P42226	847 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ACLY	P53396	1101 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	PRKCE	Q02156	737 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	POTEG	Q6S5H5	508 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	KAT2B	Q92831	832 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	TIGD1	Q96MW7	591 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	PANK2	Q9BZ23	570 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF202	O95125	648 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	MBD3	O95983	291 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	SLFN14	P0C7P3	912 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF286B	P0CG31	522 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	PSEN2	P49810	448 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	PLCB4	Q15147	1175 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	E2F4	Q16254	413 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	KANK3	Q6NY19	840 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	PDILT	Q8N807	584 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	PHF24	Q9UPV7	400 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	CEP290	O15078	2479 aa		18.76	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691		A0A087X0B3	334 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	PSMC6	P62333	389 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	AMPD3	Q01432	767 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	MFSD10	Q14728	455 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	ANO5	Q75V66	913 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	TRIM50	Q86XT4	487 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		18.75	■□□□□ 0.59
TBCD-223	ENST00000576691	RAD54L	Q92698	747 aa		18.75	■□□□□ 0.59

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