RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576069.5

SPNS3-206, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 834 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-206ENST00000576069 SCLYQ96I15 445 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 COL1A2P08123 1366 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF862O60290 1169 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 THPOP40225 353 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 TXKP42681 527 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 IGBP1P78318 339 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 OATP04181 439 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 PFKMP08237 780 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 SYT1P21579 422 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 PSMC5P62195 406 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 UGCGQ16739 394 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.79■■□□□ 1.08
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SPNS3-206ENST00000576069 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 OR52Z1P0C646 297 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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SPNS3-206ENST00000576069 SHHQ15465 462 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 XKR3Q5GH77 459 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 TMEM240Q5SV17 173 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 BRAPQ7Z569 592 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 RSPH3Q86UC2 560 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 RSPH10BP0C881 870 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 ACRP10323 421 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 KLRC1P26715 233 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 FAM26DQ5JW98 314 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 BANK1Q8NDB2 785 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 VWCEQ96DN2 955 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
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SPNS3-206ENST00000576069 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPNS3-206ENST00000576069 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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SPNS3-206ENST00000576069 STBD1O95210 358 aa21.76■■□□□ 1.07
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SPNS3-206ENST00000576069 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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SPNS3-206ENST00000576069 NBR1Q14596 966 aa21.76■■□□□ 1.07
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SPNS3-206ENST00000576069 ZNF365Q70YC5 407 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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SPNS3-206ENST00000576069 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 MAGEB2O15479 319 aa21.75■■□□□ 1.07
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SPNS3-206ENST00000576069 CXCL10P02778 98 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 PTGDRQ13258 359 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 C4orf19Q8IY42 314 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 NEK9Q8TD19 979 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 NBNO60934 754 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 C22orf31O95567 290 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 TECP42680 631 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 PDIA5Q14554 519 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 HERVK_113Q902F9 699 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 DYDC2Q96IM9 177 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 LXNQ9BS40 222 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 RGL1Q9NZL6 768 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 KAT6AQ92794 2004 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.73■■□□□ 1.07
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SPNS3-206ENST00000576069 IER5Q5VY09 327 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SPNS3-206ENST00000576069 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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