RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
STX4-216ENST00000566353 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.02■■□□□ 1.44
STX4-216ENST00000566353 NCK2O43639 380 aa24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 MMP1P03956 469 aa24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 SREBF1P36956 1147 aa24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 PAK2Q13177 524 aa24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 AP3B2Q13367 1082 aa24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 PLVAPQ9BX97 442 aa24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 BARHL2Q9NY43 387 aa24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 POTEB3A0JP26 581 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 SMCO2A6NFE2 343 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 MEIS1O00470 390 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 ATG7O95352 703 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 LTBRP36941 435 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 HYAL1Q12794 435 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 POTEBQ6S5H4 581 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CRIPAKQ8N1N5 446 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 PADI3Q9ULW8 664 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 MYO7AQ13402 2215 aa24■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CSPG5O95196 566 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 SLC26A2P50443 739 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 ZP2Q05996 745 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 SKAP1Q86WV1 359 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.99■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CCNE2O96020 404 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 STAG3L1P0CL83 205 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 SCG2P13521 617 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 ZNF76P36508 570 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 KRT76Q01546 638 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 RASEFQ8IZ41 740 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 NME8Q8N427 588 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 P2RX5Q93086 422 aa23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 BACH1O14867 736 aa23.97■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 ALADP13716 330 aa23.97■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CDC27P30260 824 aa23.97■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.97■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.97■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 TMX1Q9H3N1 280 aa23.97■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.97■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 PRR33A8MZF0 331 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 HBP1O60381 514 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 KLRC1P26715 233 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 RCAN1P53805 252 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CAMK1Q14012 370 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 KRT32Q14532 448 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CLUL1Q15846 466 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.96■■□□□ 1.43
STX4-216ENST00000566353 COL1A2P08123 1366 aa23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 FAM86B1E9PN63 330 aa23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 TBX10O75333 385 aa23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 ITGB1P05556 798 aa23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.421e-21■■■■□ 25.4
STX4-216ENST00000566353 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 IGFLR1Q9H665 355 aa23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 ZNF302Q9NR11 478 aa23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.95■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 C19orf67A6NJJ6 358 aa23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 DCXO43602 365 aa23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 DNAJB1P25685 340 aa23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 GATMP50440 423 aa23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 GINS2Q9Y248 185 aa23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
STX4-216ENST00000566353 LINC01565O15544 149 aa23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms