RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566047.5

CMC2-215, Transcript of C-X9-C motif containing 2, human

TSL 2

Gene CMC2, Length 660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CMC2-215	ENST00000566047	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047		Q8TCH9	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	LMF1	Q96S06	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CMC2-215	ENST00000566047	FOXS1	O43638	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	EFCAB14	O75071	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ZNF623	O75123	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	RASGRP1	O95267	797 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	MPIG6B	O95866	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	HERVK_113	P62684	666 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	MME	P08473	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	RRAD	P55042	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	STIL	Q15468	1287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	MKL1	Q969V6	931 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SCLY	Q96I15	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	MUSK	O15146	869 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ADCY8	P40145	1251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	RAC3	P60763	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047		Q8N1X5	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	MATN2	O00339	956 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SCD	O00767	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	KCNQ2	O43526	872 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	HMGCR	P04035	888 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	C6	P13671	934 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TACR2	P21452	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	KCNQ1	P51787	676 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TBR1	Q16650	682 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62	1e-6	■■■■■ 28.8
CMC2-215	ENST00000566047	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	KCNA6	P17658	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	ECE1	P42892	770 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	CD83	Q01151	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	NFYC	Q13952	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CMC2-215	ENST00000566047	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms