RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		20.18	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	FAM196B	A6NMK8	535 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559		A6NNZ2	444 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	MEIS1	O00470	390 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	PPFIA4	O75335	1185 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	FLOT1	O75955	427 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	EYA4	O95677	639 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	FTCD	O95954	541 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFB10	O96000	172 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	APBA1	Q02410	837 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	PTK2	Q05397	1052 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	SRL	Q86TD4	932 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	VAV3	Q9UKW4	847 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3CD	O00329	1044 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	MSH4	O15457	936 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	NR3C1	P04150	777 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	SLURP2	P0DP57	97 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	BMP3	P12645	472 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	PON1	P27169	355 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	HOXD13	P35453	343 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF76	P36508	570 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	CACNB3	P54284	484 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	TNNC1	P63316	161 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	USH1G	Q495M9	461 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	HINFP	Q9BQA5	517 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		20.17	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	SLC9A1	P19634	815 aa		20.16	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	RPS6KA1	Q15418	735 aa		20.16	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		20.16	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		20.16	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	PBK	Q96KB5	322 aa		20.16	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		20.16	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		20.16	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	20.16	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP3	O75969	853 aa		20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	MYB	P10242	640 aa		20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	GCNT3	O95395	438 aa		20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	ACTN1	P12814	892 aa		20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	EPHA7	Q15375	998 aa		20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	SLC15A2	Q16348	729 aa		20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	DACT2	Q5SW24	774 aa		20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	NAGPA	Q9UK23	515 aa		20.15	■□□□□ 0.82
RRN3-205	ENST00000563559	MYO1C	O00159	1063 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	GLI1	P08151	1106 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	MREG	Q8N565	214 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	USP38	Q8NB14	1042 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	WHAMM	Q8TF30	809 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	INTU	Q9ULD6	942 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	ASTN1	O14525	1302 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	ENTPD3	O75355	529 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	GUCY2D	Q02846	1103 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	NFIL3	Q16649	462 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35C1	Q96A29	364 aa		20.14	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		20.13	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	GFPT2	O94808	682 aa		20.13	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	GDF11	O95390	407 aa		20.13	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SNAP25	P60880	206 aa		20.13	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4A11	Q02928	519 aa		20.13	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		20.13	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		20.13	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	KRT12	Q99456	494 aa		20.13	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		20.13	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		20.13	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM37	O94972	964 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	KIF4A	O95239	1232 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	FER	P16591	822 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	MUT	P22033	750 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	DNA2	P51530	1060 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	JAM2	P57087	298 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	SLC20A2	Q08357	652 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		20.12	■□□□□ 0.81
RRN3-205	ENST00000563559	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	20.12	■□□□□ 0.81

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