RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557944.1

MFGE8-204, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 435 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-204ENST00000557944 SNX17Q15036 470 aa22.07■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 UGCGQ16739 394 aa22.07■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.07■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.07■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 GRIN2DO15399 1336 aa22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 NRCAMQ92823 1304 aa22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 ZNF862O60290 1169 aa22.06■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 GRIN1Q05586 938 aa22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.06■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.06■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 MED24O75448 989 aa22.05■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 ATP4AP20648 1035 aa22.05■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 CDK7P50613 346 aa22.05■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 PPFIA1Q13136 1202 aa22.05■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.05■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 CALML4Q96GE6 196 aa22.05■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.05■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 NACC1Q96RE7 527 aa22.05■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.05■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.04■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 CDC25AP30304 524 aa22.04■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 HYIQ5T013 277 aa22.04■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.04■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.04■■□□□ 1.12
MFGE8-204ENST00000557944 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.04■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.03■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 SETD4Q9NVD3 440 aa22.02■■□□□ 1.12
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MFGE8-204ENST00000557944 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.01■■□□□ 1.11
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MFGE8-204ENST00000557944 NOD1Q9Y239 953 aa22.01■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 A0A1W2PQ27 194 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 A0A1W2PQ64 194 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 A0A1W2PQD8 194 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 MAGEB2O15479 319 aa22■■□□□ 1.11
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MFGE8-204ENST00000557944 CMA1P23946 247 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 RTP1P59025 263 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 GRB10Q13322 594 aa22■■□□□ 1.11
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MFGE8-204ENST00000557944 PTGISQ16647 500 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 LRRC26Q2I0M4 334 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 TRIM60Q495X7 471 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 TMEM119Q4V9L6 283 aa22■■□□□ 1.11
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MFGE8-204ENST00000557944 RESP18Q5W5W9 173 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 SHC4Q6S5L8 630 aa22■■□□□ 1.11
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MFGE8-204ENST00000557944 GBP4Q96PP9 640 aa22■■□□□ 1.11
MFGE8-204ENST00000557944 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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