RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	AXIN1	O15169	862 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GH1	P01241	217 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	GPC5	P78333	572 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ABCD4-222	ENST00000555617	TK2	O00142	265 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	NTRK1	P04629	796 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PDE4D	Q08499	809 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	MGAT3	Q09327	533 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CWH43	Q9H720	699 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ATM	Q13315	3056 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	FNTB	P49356	437 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	HTR4	Q13639	388 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	WTAP	Q15007	396 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	F5	P12259	2224 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CAND2	O75155	1236 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	FBN3	Q75N90	2809 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SORBS3	O60504	671 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CCR10	P46092	362 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	MDM1	Q8TC05	714 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SHD	Q96IW2	340 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CEACAM1	P13688	526 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CD52	P31358	61 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	MAGEA9	P43362	315 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	KCNC4	Q03721	635 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	DEFB124	Q8NES8	71 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	EML5	Q05BV3	1969 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	CALML3	P27482	149 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SATB1	Q01826	763 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	EDEM2	Q9BV94	578 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCD4-222	ENST00000555617	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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