RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549279.1

TPCN1-212, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-212ENST00000549279 CHMP2AO43633 222 aa22.75■■□□□ 1.23
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TPCN1-212ENST00000549279 FOSBP53539 338 aa22.75■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 IKBKEQ14164 716 aa22.75■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 FAM26DQ5JW98 314 aa22.75■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 RDM1Q8NG50 284 aa22.75■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.75■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.75■■□□□ 1.23
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TPCN1-212ENST00000549279 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.75■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.75■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 PBX2P40425 430 aa22.74■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
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TPCN1-212ENST00000549279 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.74■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 TET1Q8NFU7 2136 aa22.74■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 TNFRSF25Q93038 417 aa22.74■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 FAM167AQ96KS9 214 aa22.74■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.74■■□□□ 1.23
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TPCN1-212ENST00000549279 SLC37A4O43826 429 aa22.73■■□□□ 1.23
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TPCN1-212ENST00000549279 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.73■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 SEPT8Q92599 483 aa22.73■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 GJA10Q969M2 543 aa22.73■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 C8orf76Q96K31 380 aa22.73■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 FAM20AQ96MK3 541 aa22.73■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.73■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.73■■□□□ 1.23
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TPCN1-212ENST00000549279 M0QZ92 97 aa22.72■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 TBX3O15119 743 aa22.72■■□□□ 1.23
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TPCN1-212ENST00000549279 ATP4AP20648 1035 aa22.72■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.72■■□□□ 1.23
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TPCN1-212ENST00000549279 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TPCN1-212ENST00000549279 ZNF576Q9H609 170 aa22.72■■□□□ 1.23
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TPCN1-212ENST00000549279 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.7■■□□□ 1.22
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TPCN1-212ENST00000549279 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.7■■□□□ 1.22
TPCN1-212ENST00000549279 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.7■■□□□ 1.22
TPCN1-212ENST00000549279 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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TPCN1-212ENST00000549279 KIF3AQ9Y496 699 aa22.69■■□□□ 1.22
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TPCN1-212ENST00000549279 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.68■■□□□ 1.22
TPCN1-212ENST00000549279 WDR81Q562E7 1941 aa22.68■■□□□ 1.22
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TPCN1-212ENST00000549279 C22orf31O95567 290 aa22.67■■□□□ 1.22
TPCN1-212ENST00000549279 DEFB103AP81534 67 aa22.67■■□□□ 1.22
TPCN1-212ENST00000549279 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TPCN1-212ENST00000549279 UGCGQ16739 394 aa22.67■■□□□ 1.22
TPCN1-212ENST00000549279 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.67■■□□□ 1.22
TPCN1-212ENST00000549279 USP38Q8NB14 1042 aa22.67■■□□□ 1.22
TPCN1-212ENST00000549279 HAS1Q92839 578 aa22.67■■□□□ 1.22
TPCN1-212ENST00000549279 TMX3Q96JJ7 454 aa22.67■■□□□ 1.22
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