RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548391.1

PRAMENP-203, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,445 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-203ENST00000548391 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 HBP1O60381 514 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ATP4AP20648 1035 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 USP11P51784 963 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ANAPC15P60006 121 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ERVK-21P61565 698 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SCRN1Q12765 414 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM160B1Q5W0V3 765 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 KRT40Q6A162 431 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SWSAP1Q6NVH7 229 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 AIFM3Q96NN9 605 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SUGCTQ9HAC7 445 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 PCDHA4Q9UN74 947 aa13.4□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 M0R2N6 131 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 KRT76Q01546 638 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 NPY5RQ15761 445 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 IER5Q5VY09 327 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 PDXDC2PQ6P474 469 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 MTHFD1LQ6UB35 978 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 MICALL1Q8N3F8 863 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 TBCKQ8TEA7 893 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 IL17RAQ96F46 866 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 THEGQ9P2T0 379 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 MTUS1Q9ULD2 1270 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 ZBTB42B2RXF5 422 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 MSH4O15457 936 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 PFKFB2O60825 505 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 UPP2O95045 317 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 KLRC1P26715 233 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM62Q0P6H9 643 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 TJAP1Q5JTD0 557 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 GALNT17Q6IS24 598 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 BLIDQ8IZY5 108 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 NME8Q8N427 588 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 DAGLBQ8NCG7 672 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 GDPD5Q8WTR4 605 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 YME1L1Q96TA2 773 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 SQORQ9Y6N5 450 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 COL1A2P08123 1366 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 TTC3P53804 2025 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 EVPLQ92817 2033 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 ENPP3O14638 875 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 PSAPP07602 524 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 CD52P31358 61 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF484Q5JVG2 852 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC5A5Q92911 643 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 RIT2Q99578 217 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 LMCD1Q9NZU5 365 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 GABBR1Q9UBS5 961 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 WDR81Q562E7 1941 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 STK36Q9NRP7 1315 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 WDR64B1ANS9 1081 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 M0QZ92 97 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 CDKL5O76039 1030 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 CYP3A7P24462 503 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 AK2P54819 239 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 ANKRD1Q15327 319 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 Q4G0T1 1027 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 CKAP2LQ8IYA6 745 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 GJA10Q969M2 543 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 ASB2Q96Q27 587 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 DISC1Q9NRI5 854 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 TTC28Q96AY4 2481 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 COL4A6Q14031 1691 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 GAS7O60861 476 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAMENP-203ENST00000548391 PSMD10O75832 226 aa13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms