RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 PTK2Q05397 1052 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ERFEQ4G0M1 354 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 H2AFVQ71UI9 128 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 KCNK18Q7Z418 384 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 FAM228AQ86W67 206 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 PGM2Q96G03 612 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 POLD4Q9HCU8 107 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 NCANO14594 1321 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 A0A1B0GUA9 196 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 POTEMA6NI47 508 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 DAPK3O43293 454 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 PPIP5K2O43314 1243 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 SLC37A4O43826 429 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ZPR1O75312 459 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ERCC3P19447 782 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 TMOD1P28289 359 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 KCNH2Q12809 1159 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 SLMAPQ14BN4 828 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ASPRV1Q53RT3 343 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 MIEF2Q96C03 454 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 HES6Q96HZ4 224 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 SPAG5Q96R06 1193 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 PIGSQ96S52 555 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 TRIM37O94972 964 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 TDP2O95551 362 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 AFPP02771 609 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 UCHL3P15374 230 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 FERP16591 822 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 DRG2P55039 364 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 SLC8A3P57103 927 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 PTENP60484 403 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 MSL1Q68DK7 614 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 HOOK2Q96ED9 719 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 EYA3Q99504 573 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 FMO2Q99518 471 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 TMEM260Q9NX78 707 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 AMFRQ9UKV5 643 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 CCDC169A6NNP5 214 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 F8W031 263 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 CLGNO14967 610 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 EDIL3O43854 480 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 HSPA6P17066 643 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 JAM2P57087 298 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ADAM9Q13443 819 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-202ENST00000542324 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms