RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	MTA3	Q9BTC8	594 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	OXSM	Q9NWU1	459 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	MED14	O60244	1454 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	CCND1	P24385	295 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	KIF11	P52732	1056 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	MVK	Q03426	396 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	PKN1	Q16512	942 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	DDB1	Q16531	1140 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	TOMM22	Q9NS69	142 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	EID1	Q9Y6B2	187 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	TNR	Q92752	1358 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	SLC27A2	O14975	620 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	PSPN	O60542	156 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	AMY2A	P04746	511 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	MSL3P1	P0C860	447 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	SLC9A1	P19634	815 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	AMY2B	P19961	511 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	FUT4	P22083	530 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	EPHB1	P54762	984 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	SESN3	P58005	492 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	KIR3DS1	Q14943	382 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	CPZ	Q66K79	652 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089		Q8N1Y9	231 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	EFHB	Q8N7U6	833 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	MYLIP	Q8WY64	445 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	SLC5A5	Q92911	643 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	CD244	Q9BZW8	370 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	SP110	Q9HB58	689 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-223	ENST00000536089	TIAM1	Q13009	1591 aa		5.4	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		5.4	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		5.4	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		5.4	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	DBX1	A6NMT0	343 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	PRKD3	O94806	890 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	MYBL2	P10244	700 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	LSP1	P33241	339 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	GDNF	P39905	211 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	NEK2	P51955	445 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	ERVFC1	P60507	584 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	PPP2R5A	Q15172	486 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	BROX	Q5VW32	411 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	LILRA2	Q8N149	483 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	SEC14L1	Q92503	715 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	MAN2B1	O00754	1011 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-223	ENST00000536089	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55

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