RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528627.1

NSD3-208, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 3, human

TSL 2

Gene NSD3, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD3-208	ENST00000528627	EPHA7	Q15375	998 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NSD3-208	ENST00000528627	DDB1	Q16531	1140 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NSD3-208	ENST00000528627	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NSD3-208	ENST00000528627	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NSD3-208	ENST00000528627	SLC5A5	Q92911	643 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NSD3-208	ENST00000528627	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NSD3-208	ENST00000528627	ASB1	Q9Y576	335 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NSD3-208	ENST00000528627	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	EVA1C	P58658	441 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	TERF2	Q15554	542 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	KCNN1	Q92952	543 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	GBP4	Q96PP9	640 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ZMAT4	Q9H898	229 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	WASF3	Q9UPY6	502 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ZNF839	A8K0R7	811 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	GLDC	P23378	1020 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	LSP1	P33241	339 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	SESN3	P58005	492 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	FAP	Q12884	760 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	BROX	Q5VW32	411 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	VASN	Q6EMK4	673 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	NME9	Q86XW9	330 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	MED14OS	P0DP75	135 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	THBS2	P35442	1172 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	GUCY2F	P51841	1108 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	LIPI	Q6XZB0	460 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	TMEM209	Q96SK2	561 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	PTGS1	P23219	599 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	CD40	P25942	277 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ITGA1	P56199	1179 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	FOXO4	P98177	505 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	PFKP	Q01813	784 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ADCY1	Q08828	1119 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	RASSF3	Q86WH2	238 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	DTX3	Q8N9I9	347 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	COG1	Q8WTW3	980 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	DLL4	Q9NR61	685 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627		K7ESF4	209 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	PRKD3	O94806	890 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	MPIG6B	O95866	241 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	TMEM253	P0C7T8	217 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	HIPK4	Q8NE63	616 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	E2F7	Q96AV8	911 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	SYT3	Q9BQG1	590 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	KRT1	P04264	644 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	PDGFRB	P09619	1106 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	CFP	P27918	469 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	MC4R	P32245	332 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ADAM9	Q13443	819 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	FERMT3	Q86UX7	667 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	FOXB1	Q99853	325 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	INCENP	Q9NQS7	918 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	LIMS1	P48059	325 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	HTRA3	P83110	453 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	MTMR1	Q13613	665 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	CNTD1	Q8N815	330 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	KY	Q8NBH2	561 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	NOX5	Q96PH1	765 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NSD3-208	ENST00000528627	MENT	Q9BUN1	341 aa		7.28	□□□□□ -1.24

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