RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524226.5

PCM1-222, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCM1, Length 5,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-222	ENST00000524226	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CPXCR1	Q8N123	301 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FAM71B	Q8TC56	605 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	URGCP	Q8TCY9	931 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	IFT81	Q8WYA0	676 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FNBP1	Q96RU3	617 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	IFNK	Q9P0W0	207 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	NYAP2	Q9P242	653 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	GINS2	Q9Y248	185 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TMEM232	C9JQI7	657 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226		F8W8V4	182 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TTC4	O95801	387 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SLFN14	P0C7P3	912 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PDHB	P11177	359 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	BMP3	P12645	472 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TMOD1	P28289	359 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MAN1A1	P33908	653 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TXK	P42681	527 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ESRRG	P62508	458 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FANCC	Q00597	558 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SLMAP	Q14BN4	828 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CCL15	Q16663	113 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MUM1	Q2TAK8	710 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	USH1G	Q495M9	461 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	DACT2	Q5SW24	774 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TBCK	Q8TEA7	893 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	NLRP7	Q8WX94	980 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PAGE5	Q96GU1	130 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226		H0YCG3	227 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ARHGAP6	O43182	974 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TOMM70	O94826	608 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	STAT2	P52630	851 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	COG7	P83436	770 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PAK1	Q13153	545 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	AP3B2	Q13367	1082 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CCDC25	Q86WR0	208 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	GLG1	Q92896	1179 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	GSDMA	Q96QA5	445 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MMP19	Q99542	508 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	AMN	Q9BXJ7	453 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	AAAS	Q9NRG9	546 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226		E9PMD0	336 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ATP8B1	O43520	1251 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RARB	P10826	455 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	BCR	P11274	1271 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SLC16A2	P36021	539 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TEC	P42680	631 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF543	Q08ER8	600 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PLCB4	Q15147	1175 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RPS6KA2	Q15349	733 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ASIC2	Q16515	512 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PDXDC1	Q6P996	788 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CERS5	Q8N5B7	392 aa		2.8	□□□□□ -1.96

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