RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	AOAH	P28039	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	POLD1	P28340	1107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	TBR1	Q16650	682 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68	1e-6	■□□□□ 8.9
CDK1-208	ENST00000519760	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760		Q8TCH9	128 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	MKL1	Q969V6	931 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	LMF1	Q96S06	567 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CDK1-208	ENST00000519760	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	GSTA4	O15217	222 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	EFCAB14	O75071	495 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF623	O75123	536 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	NAT1	P18440	290 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	GJA4	P35212	333 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	KCNQ1	P51787	676 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	CD83	Q01151	205 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	MATN2	O00339	956 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	ECE1	P42892	770 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	HERVK_113	P62684	666 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	ZXDA	P98168	799 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	STIL	Q15468	1287 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	DLG3	Q92796	817 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	FOXP2	O15409	715 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	KCNQ2	O43526	872 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760		M0R2C6	588 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	DVL2	O14641	736 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	CUTA	O60888	179 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CDK1-208	ENST00000519760	KRT37	O76014	449 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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