RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 FEM1BQ9UK73 627 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GUL6 1792 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 COASYQ13057 564 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ADAM9Q13443 819 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TC2NQ8N9U0 490 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 INTS13Q9NVM9 706 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FAM170AA1A519 330 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MEIS2O14770 477 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MFAP3LO75121 409 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 HMGCS2P54868 508 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 DGKZQ13574 1117 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 C16orf87Q6PH81 154 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 RRAGAQ7L523 313 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FAM20AQ96MK3 541 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MTMR9Q96QG7 549 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FAM86B1E9PN63 330 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 BACH1O14867 736 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 EGFRP00533 1210 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 NR2F2P24468 414 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 CEP55Q53EZ4 464 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 FAM83AQ86UY5 434 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MB21D1Q8N884 522 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PHC3Q8NDX5 983 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 HAS1Q92839 578 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PNMA5Q96PV4 448 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 MED15Q96RN5 788 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 CARD6Q9BX69 1037 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 THAP9Q9H5L6 903 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 GGA3Q9NZ52 723 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 SLX4Q8IY92 1834 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-208ENST00000519076 TTC26A0AVF1 554 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 LGALS16A8MUM7 142 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CLIC2O15247 247 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SULF1Q8IWU6 871 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 C3orf20Q8ND61 904 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ODF2LQ9ULJ1 636 aa8.59□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 MSH4O15457 936 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 MED24O75448 989 aa8.58□□□□□ -1.04
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TRPS1-208ENST00000519076 PYGLP06737 847 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PEX19P40855 299 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RAB27AP51159 221 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SNX1Q13596 522 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ODR4Q5SWX8 454 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 SFR1Q86XK3 245 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 DYDC2Q96IM9 177 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 RMDN3Q96TC7 470 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 NDST4Q9H3R1 872 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-208ENST00000519076 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.58□□□□□ -1.04
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