RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 FGBP02675 491 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF174Q15697 407 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF365Q70YC5 407 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 WNT8BQ93098 351 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.14■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 WNT7AO00755 349 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 RSPH10BP0C881 870 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 ATP4AP20648 1035 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TXKP42681 527 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM240Q5SV17 173 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 KAT6AQ92794 2004 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 EML1O00423 815 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 OATP04181 439 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 ACTN1P12814 892 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 PSMC5P62195 406 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 PRKCEQ02156 737 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 EPHA7Q15375 998 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 MTMR9Q96QG7 549 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.12■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF862O60290 1169 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 OR52Z1P0C646 297 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 KLRC1P26715 233 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 UGCGQ16739 394 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 XKR3Q5GH77 459 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 RPAINQ86UA6 219 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 BANK1Q8NDB2 785 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 CTSHP09668 335 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 HERVK_113Q902F9 699 aa20.1■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 M0QZ92 97 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 MAGEB2O15479 319 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 IER5Q5VY09 327 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 NME8Q8N427 588 aa20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 ZBBXA8MT70 800 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 NBNO60934 754 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 CXCL10P02778 98 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 NBR1Q14596 966 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 FAM26DQ5JW98 314 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 BRAPQ7Z569 592 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 METTL13Q8N6R0 699 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 NEK9Q8TD19 979 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.08■□□□□ 0.81
FAAP20-215ENST00000514625 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 LAD1O00515 517 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 C22orf31O95567 290 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 SYT1P21579 422 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 TMOD1P28289 359 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 TECP42680 631 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 PTGDRQ13258 359 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 TPH2Q8IWU9 490 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 VWCEQ96DN2 955 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 DYDC2Q96IM9 177 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 LXNQ9BS40 222 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-215ENST00000514625 RGL1Q9NZL6 768 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms