RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 COL4A6Q14031 1691 aa21.16■□□□□ 0.98
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SH3BP2-218ENST00000511185 PSMD10O75832 226 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-218ENST00000511185 BAIAP3O94812 1187 aa21.16■□□□□ 0.98
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SH3BP2-218ENST00000511185 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-218ENST00000511185 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-218ENST00000511185 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-218ENST00000511185 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-218ENST00000511185 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
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