RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		18.92	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	PFKFB2	O60825	505 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	AR	P10275	920 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	ADCY7	P51828	1080 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	IGBP1	P78318	339 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	COL19A1	Q14993	1142 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	NEK9	Q8TD19	979 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	GLG1	Q92896	1179 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		18.91	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	ENPP3	O14638	875 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	ADAMTS3	O15072	1205 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	INSRR	P14616	1297 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	SCRN1	Q12765	414 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	PKN1	Q16512	942 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	BANK1	Q8NDB2	785 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	KIF2C	Q99661	725 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM260	Q9NX78	707 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
MIB2-223	ENST00000508148	ESYT2	A0FGR8	921 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	DEXI	O95424	95 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	CTNNB1	P35222	781 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	PLCB4	Q15147	1175 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	ANO3	Q9BYT9	981 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	STK36	Q9NRP7	1315 aa		18.89	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	SMCO2	A6NFE2	343 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	GRM6	O15303	877 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	CD52	P31358	61 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	ACTR2	P61160	394 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	RABEP1	Q15276	862 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	PTPRO	Q16827	1216 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	FIBCD1	Q8N539	461 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	GTF3C6	Q969F1	213 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	NFASC	O94856	1347 aa		18.88	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	MAFG	O15525	162 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	PPFIA3	O75145	1194 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	CCNE2	O96020	404 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	LTBR	P36941	435 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	PLA2G5	P39877	138 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	AP3B2	Q13367	1082 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	ME3	Q16798	604 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	C6orf50	Q9HD87	102 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		18.87	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	DGKI	O75912	1065 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	ATG7	O95352	703 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	LARGE1	O95461	756 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	GNA11	P29992	359 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	BMPR1A	P36894	532 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	SREBF1	P36956	1147 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	CAMK1	Q14012	370 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	MCTP2	Q6DN12	878 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	RSPH3	Q86UC2	560 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	C5orf42	Q9H799	3197 aa		18.86	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	POTEB3	A0JP26	581 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	MEIS1	O00470	390 aa		18.85	■□□□□ 0.61
MIB2-223	ENST00000508148	CSPG5	O95196	566 aa		18.85	■□□□□ 0.61

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