RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOA5Q6Q788 366 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SARM1Q6SZW1 724 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 BRAPQ7Z569 592 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MICU3Q86XE3 530 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 FSIP1Q8NA03 581 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 WASF1Q92558 559 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKS1AQ92625 1134 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 C8orf76Q96K31 380 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM5Q9C035 493 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SH2D4AQ9H788 454 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PICK1Q9NRD5 415 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANO10Q9NW15 660 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 NYAP2Q9P242 653 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTMR7Q9Y216 660 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAXQ9Y2V3 346 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.35□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CNTNAP1P78357 1384 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDAH1O94760 285 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GH2P01242 217 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACPPP15309 386 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 EPHA1P21709 976 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CAP2P40123 477 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 GUCY1B3Q02153 619 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRKG1Q13976 671 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM29Q14134 588 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEPT2Q15019 361 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 IQCB1Q15051 598 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEC23AQ15436 765 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP135Q66GS9 1140 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADALQ6DHV7 355 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACAD11Q709F0 780 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MKL1Q969V6 931 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP95Q96GE4 821 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 TEPSINQ96N21 525 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAP3K14Q99558 947 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 CSADQ9Y600 493 aa6.34□□□□□ -1.39
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 BECN2A8MW95 431 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEMFO60524 1076 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF4AO95239 1232 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGLV1-40P01703 118 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 RXRAP19793 462 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ICA1Q05084 483 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR152Q8TDT2 470 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 COL26A1Q96A83 441 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 WRNIP1Q96S55 665 aa6.33□□□□□ -1.4
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYL10Q9BUA6 226 aa6.33□□□□□ -1.4
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