RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1-208ENST00000489824 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1-208ENST00000489824 NCK2O43639 380 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1-208ENST00000489824 CDC27P30260 824 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1-208ENST00000489824 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1-208ENST00000489824 MCTP2Q6DN12 878 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1-208ENST00000489824 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1-208ENST00000489824 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1-208ENST00000489824 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KB1-208ENST00000489824 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 STAG3L1P0CL83 205 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 SCG2P13521 617 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 KRT76Q01546 638 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 GJD3Q8N144 294 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 C6orf50Q9HD87 102 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 CLDND1Q9NY35 253 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 PADI3Q9ULW8 664 aa22.14■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 HBP1O60381 514 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 DGKIO75912 1065 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 ATG7O95352 703 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 IL9P15248 144 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 APOBRQ0VD83 1088 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 NEK9Q8TD19 979 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 PLVAPQ9BX97 442 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF302Q9NR11 478 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 GINS2Q9Y248 185 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 GRM6O15303 877 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 CSPG5O95196 566 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCNE2O96020 404 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 KLRC1P26715 233 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 Q6ZUG5 572 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM86B1E9PN63 330 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 ODR4Q5SWX8 454 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 BRF1Q92994 677 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 CD320Q9NPF0 282 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 COL1A2P08123 1366 aa22.11■■□□□ 1.13
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RPS6KB1-208ENST00000489824 CYP3A4P08684 503 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 CPA1P15085 419 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 GNA11P29992 359 aa22.1■■□□□ 1.13
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RPS6KB1-208ENST00000489824 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.1■■□□□ 1.13
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RPS6KB1-208ENST00000489824 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM122AQ96E09 287 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 UIMC1Q96RL1 719 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 RPS6KA5O75582 802 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 MMP1P03956 469 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 LINC00271P0C7V0 271 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 BICD2Q8TD16 824 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.138e-17■■■■■ 26.8
RPS6KB1-208ENST00000489824 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS6KB1-208ENST00000489824 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.08■■□□□ 1.13
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