RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 GLRBP48167 497 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 FNTBP49356 437 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 OCRLQ01968 901 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 WDR48Q8TAF3 677 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ASB15Q8WXK1 588 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 GBP4Q96PP9 640 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 INCENPQ9NQS7 918 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 BTBD7Q9P203 1132 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.33□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 A0A1B0GTL3 188 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 TRIM13O60858 407 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 BMP7P18075 431 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 DSG1Q02413 1049 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 FAM124AQ86V42 546 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 NME9Q86XW9 330 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 PASD1Q8IV76 773 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 SCYL1Q96KG9 808 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 SPATA25Q9BR10 227 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 KCND1Q9NSA2 647 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 OXSMQ9NWU1 459 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 GALNT8Q9NY28 637 aa6.32□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 MASP1P48740 699 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 GJA9P57773 515 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 RTP5Q14D33 572 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 NXPE1Q8N323 547 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 EFHBQ8N7U6 833 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 STPG3Q8N7X2 389 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CALML6Q8TD86 181 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.31□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 C9orf118A6NHY6 69 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 RASSF10A6NK89 507 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 H0Y858 1186 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 DVL2O14641 736 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 KNG1P01042 644 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 MC4RP32245 332 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 STAT3P40763 770 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ADCY1Q08828 1119 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 EPHA7Q15375 998 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 DHCR24Q15392 516 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 PHF19Q5T6S3 580 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 C11orf74Q86VG3 221 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 KCNC2Q96PR1 638 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 BTBD2Q9BX70 525 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 TOMM22Q9NS69 142 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 USP40Q9NVE5 1235 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.3□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 MPIG6BO95866 241 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 IL18BPO95998 194 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 COL6A1P12109 1028 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ECE1P42892 770 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 LSSP48449 732 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 IL2P60568 153 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 RGL3Q3MIN7 710 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 MCTP2Q6DN12 878 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 RNF180Q86T96 592 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 USP7Q93009 1102 aa6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTEN-204ENST00000487939 FOXB1Q99853 325 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms