RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487305.5

TMEM39B-208, Transcript of transmembrane protein 39B, human

TSL 2

Gene TMEM39B, Length 2,087 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM39B-208	ENST00000487305	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARL8A	Q96BM9	186 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	MS4A14	Q96JA4	679 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	PPP1R37	O75864	691 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	FTCD	O95954	541 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	MYZAP	P0CAP1	466 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	PON1	P27169	355 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	GBP1	P32455	592 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	CROCCP2	Q86T23	111 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	AMN	Q9BXJ7	453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	POTEC	B2RU33	542 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	KCNK3	O14649	394 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	INPP5B	P32019	993 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	LSP1	P33241	339 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	SREBF1	P36956	1147 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	STAT1	P42224	750 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	KCNQ4	P56696	695 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	JAM2	P57087	298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	EPHA7	Q15375	998 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	KCND2	Q9NZV8	630 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	RAD51C	O43502	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	EYA4	O95677	639 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	SERPINB2	P05120	415 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	CYP3A4	P08684	503 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	ICE2	Q659A1	982 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	PEX26	Q7Z412	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	MED24	O75448	989 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM107A	O95990	144 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	NR3C1	P04150	777 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	HSPA6	P17066	643 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	GTF2I	P78347	998 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	PICALM	Q13492	652 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	P3H4	Q92791	437 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	RAB17	Q9H0T7	212 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TMEM39B-208	ENST00000487305	CEP104	O60308	925 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	KRT14	P02533	472 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	PTGIS	Q16647	500 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	EHD2	Q9NZN4	543 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	NCAN	O14594	1321 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	FSBP	O95073	299 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARID5A	Q03989	594 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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