RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 TOP1MTQ969P6 601 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 LPXNO60711 386 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 ATP4AP20648 1035 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 ERVK-21P61565 698 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 TBCKQ8TEA7 893 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.3■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 VCANP13611 3396 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 MSH4O15457 936 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 HBP1O60381 514 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 KLRC1P26715 233 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 USP11P51784 963 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 IER5Q5VY09 327 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 BLIDQ8IZY5 108 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 THEGQ9P2T0 379 aa21.29■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 KAT6AQ92794 2004 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 ANAPC15P60006 121 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 KRT76Q01546 638 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 NPY5RQ15761 445 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 GJA10Q969M2 543 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 YME1L1Q96TA2 773 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.28■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 M0QZ92 97 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 M0R2N6 131 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 ENPP3O14638 875 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 PFKFB2O60825 505 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 PSAPP07602 524 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 CD52P31358 61 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 AK2P54819 239 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 TJAP1Q5JTD0 557 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 SAMM50Q9Y512 469 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.27■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 CDKL5O76039 1030 aa21.26■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.26■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.26■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.26■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 CHMP2AO43633 222 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 TDP2O95551 362 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 GALNT17Q6IS24 598 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 NME8Q8N427 588 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 SLC5A5Q92911 643 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 ASB2Q96Q27 587 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 DISC1Q9NRI5 854 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 GINS2Q9Y248 185 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 SQORQ9Y6N5 450 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 SIP14410 1827 aa21.25■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 COL1A2P08123 1366 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 WDR64B1ANS9 1081 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 GAS7O60861 476 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 CTDNEP1O95476 244 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 SEC24BO95487 1268 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 Q4G0T1 1027 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 RIT2Q99578 217 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 PADI3Q9ULW8 664 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.24■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.23■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 C22orf31O95567 290 aa21.23■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 CYP3A7P24462 503 aa21.23■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 TFF2Q03403 129 aa21.23■□□□□ 0.99
UPP1-211ENST00000482015 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms