RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 CUL5Q93034 780 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 FBXL18Q96ME1 805 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PHOX2BQ99453 314 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MXRA8Q9BRK3 442 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa12.44□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 DHX15O43143 795 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MCM5P33992 734 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 LIFRP42702 1097 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 SGMS1Q86VZ5 419 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 LZTS2Q9BRK4 669 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MTA3Q9BTC8 594 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 LMAN2LQ9H0V9 348 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ERVK-5Q9HDB9 667 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 RNF19AQ9NV58 838 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 TRPV2Q9Y5S1 764 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 KAT6AQ92794 2004 aa12.43□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 USP34Q70CQ2 3546 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 FAM86B1E9PN63 330 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 STXBP3O00186 592 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MEIS1O00470 390 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 EYA4O95677 639 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 FAM86B2P0C5J1 330 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CDC27P30260 824 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 KIF5BP33176 963 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CLK2P49760 499 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 GNAQP50148 359 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ADCK5Q3MIX3 580 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 FAM102BQ5T8I3 360 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CASC1Q6TDU7 716 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MTHFD1LQ6UB35 978 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ABHD15Q6UXT9 468 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 NFXL1Q6ZNB6 911 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MICU3Q86XE3 530 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 RNF135Q8IUD6 432 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 FEZF2Q8TBJ5 459 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 POF1BQ8WVV4 589 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CRYGNQ8WXF5 182 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 TMEM87BQ96K49 555 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 SLC9A2Q9UBY0 812 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PRKAG3Q9UGI9 489 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MYO15AQ9UKN7 3530 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 NFASCO94856 1347 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CACNA1HO95180 2353 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CCDC69A6NI79 296 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ALADP13716 330 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ERVFC1P60507 584 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 NHLH1Q02575 133 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 IER5LQ5T953 404 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 NPAS4Q8IUM7 802 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PPP1R16BQ96T49 567 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PLVAPQ9BX97 442 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 ANO3Q9BYT9 981 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 RIC8AQ9NPQ8 531 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CDH22Q9UJ99 828 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 RRN3P2A6NIE6 340 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 SPDYE3A6NKU9 549 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PER2O15055 1255 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 MAFGO15525 162 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 KLRC1P26715 233 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 NRIP1P48552 1158 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 STAT5BP51692 787 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 DSC3Q14574 896 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CEP55Q53EZ4 464 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 APOA5Q6Q788 366 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 LRRC55Q6ZSA7 311 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 FAM228AQ86W67 206 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 PRSS33Q8NF86 280 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 P2RX5Q93086 422 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CDHR1Q96JP9 859 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CWH43Q9H720 699 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-206ENST00000474188 CD207Q9UJ71 328 aa12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms