RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473460.1

GINS1-202, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GINS1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-202ENST00000473460 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 MC4RP32245 332 aa5.38□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 ADCY8P40145 1251 aa5.38□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 FOXL1Q12952 345 aa5.38□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 STILQ15468 1287 aa5.38□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 GPR19Q15760 415 aa5.38□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 WDR72Q3MJ13 1102 aa5.38□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.38□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.38□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.38□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 AMNQ9BXJ7 453 aa5.37□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 INCENPQ9NQS7 918 aa5.37□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 GALNT8Q9NY28 637 aa5.37□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 PYGMP11217 842 aa5.36□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 TCF3P15923 654 aa5.36□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 JAM2P57087 298 aa5.36□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 DPTQ07507 201 aa5.36□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 PAK1Q13153 545 aa5.36□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 FIGNQ5HY92 759 aa5.36□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 USP30Q70CQ3 517 aa5.36□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 FAM89AQ96GI7 184 aa5.36□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.36□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.36□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.35□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 DPH6Q7L8W6 267 aa5.35□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 SPATA9Q9BWV2 254 aa5.35□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.35□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 TLR9Q9NR96 1032 aa5.35□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.35□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 AQP7O14520 342 aa5.34□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 KRT15P19012 456 aa5.34□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 HERVK_113P62684 666 aa5.34□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.34□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.34□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.34□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 PTPRN2Q92932 1015 aa5.34□□□□□ -1.55
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GINS1-202ENST00000473460 BTBD2Q9BX70 525 aa5.34□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 MSL2Q9HCI7 577 aa5.34□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 CEP72Q9P209 647 aa5.34□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.34□□□□□ -1.55
GINS1-202ENST00000473460 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.33□□□□□ -1.56
GINS1-202ENST00000473460 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
GINS1-202ENST00000473460 TGM1P22735 817 aa5.33□□□□□ -1.56
GINS1-202ENST00000473460 MRE11P49959 708 aa5.33□□□□□ -1.56
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