RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469223.5

HDAC6-217, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC6, Length 796 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-217ENST00000469223 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ITPR1Q14643 2758 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 EOMESO95936 686 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 CFBP00751 764 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TDGQ13569 410 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 SPECC1Q5M775 1068 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 RSPH3Q86UC2 560 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 MAF1Q9H063 256 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TOMM22Q9NS69 142 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 USTQ9Y2C2 406 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.69□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ORC4O43929 436 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 RAB11FIP3O75154 756 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 SNHG28P0DPA3 235 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 USP26Q9BXU7 913 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 LZTS1Q9Y250 596 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 NRCAMQ92823 1304 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 KINO60870 393 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 LMNB2Q03252 620 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 PAK2Q13177 524 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 PGM5Q15124 567 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 KANK3Q6NY19 840 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 GPR20Q99678 358 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 RTKNQ9BST9 563 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 KRBA1A5PL33 1030 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 OPLAHO14841 1288 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 FOXP2O15409 715 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 HMMRO75330 724 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 CFHP08603 1231 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 HSD17B4P51659 736 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 SP4Q02446 784 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 PPFIA1Q13136 1202 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 METTL7BQ6UX53 244 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 PADI3Q9ULW8 664 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 CA14Q9ULX7 337 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 LAMA4Q16363 1823 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 POTEMA6NI47 508 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TGFB3P10600 412 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 LAG3P18627 525 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 CCND2P30279 289 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ARHGAP8P85298 464 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 DMWDQ09019 674 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 GRIK4Q16099 956 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 PPM1JQ5JR12 505 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 POTEGQ6S5H5 508 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TMC7Q7Z402 723 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TMX1Q9H3N1 280 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 CWH43Q9H720 699 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 KCNK12Q9HB15 430 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 USP18Q9UMW8 372 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC6-217ENST00000469223 CA8P35219 290 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms