RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	MFSD4A	Q8N468	514 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SHISA4	Q96DD7	197 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	FAM84A	Q96KN4	292 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	MYH3	P11055	1940 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	CHL1	O00533	1208 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	TLR2	O60603	784 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	GJB1	P08034	283 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	KLRK1	P26718	216 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	PSMC4	P43686	418 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF165	P49910	485 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SNAPC2	Q13487	334 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SERINC3	Q13530	473 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	VGLL4	Q14135	290 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SEPT6	Q14141	434 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	MPP2	Q14168	576 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	RIN3	Q8TB24	985 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	KIRREL1	Q96J84	757 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	CRBN	Q96SW2	442 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	GREM2	Q9H772	168 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	STAP2	Q9UGK3	403 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SRRD	Q9UH36	339 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	MYPN	Q86TC9	1320 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	BTBD19	C9JJ37	291 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	CILP	O75339	1184 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	RAP1GAP	P47736	663 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ERO1B	Q86YB8	467 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	FBXO27	Q8NI29	283 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	UBE2F	Q969M7	185 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	DIRC2	Q96SL1	478 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	PRO3102	Q9H379	93 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	CD209	Q9NNX6	404 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	CPA4	Q9UI42	421 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	JAG2	Q9Y219	1238 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	PIEZO1	Q92508	2521 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	CACNA1F	O60840	1977 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	ETFB	P38117	255 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	CHRND	Q07001	517 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	MESP2	Q0VG99	397 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936		Q7L0L9	218 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	REC114	Q7Z4M0	266 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	CDH24	Q86UP0	819 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	HID1	Q8IV36	788 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	CERS5	Q8N5B7	392 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	HOOK2	Q96ED9	719 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SHD	Q96IW2	340 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	WRNIP1	Q96S55	665 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	PIF1	Q9H611	641 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
CEP170-209	ENST00000464936	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		5.65	□□□□□ -1.5

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