RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462219.5

LINC00879-201, long intergenic non-protein coding RNA 879, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00879, Length 695 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00879-201ENST00000462219 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 PRO3102Q9H379 93 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 HIPK3Q9H422 1215 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 RGL1Q9NZL6 768 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 SIP14410 1827 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 ARID2Q68CP9 1835 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 POTEMA6NI47 508 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 SLITRK3O94933 977 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 TECP42680 631 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 MFSD5Q6N075 450 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 BANK1Q8NDB2 785 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 VWCEQ96DN2 955 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 TRPC6Q9Y210 931 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 LAD1O00515 517 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 PITPNM1O00562 1244 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 OATP04181 439 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 GNAT1P11488 350 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 PRPHP41219 470 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 PSMC5P62195 406 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 PRKCEQ02156 737 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 GPNMBQ14956 572 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 DYDC2Q96IM9 177 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 CEP89Q96ST8 783 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 NOD1Q9Y239 953 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 COL1A2P08123 1366 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 TCHHQ07283 1943 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 TMEM150BA6NC51 233 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 IQCF3P0C7M6 154 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 CKBP12277 381 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 KLRC1P26715 233 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 EPHB4P54760 987 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 CCL23P55773 120 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 IGBP1P78318 339 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 BECN1Q14457 450 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 PDIA5Q14554 519 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 PTPAQ15257 358 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 ANO5Q75V66 913 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 RPAINQ86UA6 219 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 C4orf19Q8IY42 314 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 CAGE1Q8TC20 777 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 FAM167AQ96KS9 214 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00879-201ENST00000462219 ZBTB39O15060 712 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 LYPLA2O95372 231 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CSF2RAP15509 400 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 BMP8BP34820 402 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CYP4A11Q02928 519 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 BFSP2Q13515 415 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 XKR3Q5GH77 459 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 SCLYQ96I15 445 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 LXNQ9BS40 222 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CLIC4Q9Y696 253 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 MED24O75448 989 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 C22orf31O95567 290 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 F13A1P00488 732 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 FPGSQ05932 587 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00879-201ENST00000462219 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms