RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438133.5

SUMF2-211, Transcript of sulfatase modifying factor 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUMF2, Length 1,771 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF2-211ENST00000438133 COL6A1P12109 1028 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 PPP1R2P41236 205 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 OAZ1P54368 228 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 CBX1P83916 185 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 MORN1Q5T089 497 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 UNC13DQ70J99 1090 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 REPS2Q8NFH8 660 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 ARID3AQ99856 593 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 COL20A1Q9P218 1284 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 VAV3Q9UKW4 847 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.68□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 MED24O75448 989 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 RPA1P27694 616 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 LHX8Q68G74 356 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 SLC5A5Q92911 643 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.67□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 POTEB3A0JP26 581 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 PSMA7O14818 248 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 PSMD10O75832 226 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 FAM193AP78312 1265 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 POTEBQ6S5H4 581 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 TMC6Q7Z403 805 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 DDX12PQ92771 950 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.66□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 E9PMD0 336 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 ATP2A1O14983 1001 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 PLA2G4BP0C869 781 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 STK4Q13043 487 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 MAP2K5Q13163 448 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 PPP2R5CQ13362 524 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 DYMQ7RTS9 669 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 VSTM4Q8IW00 320 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 ARP10275 920 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 PSMD2Q13200 908 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 WDR78Q5VTH9 848 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 RNF146Q9NTX7 359 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 INTS13Q9NVM9 706 aa14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SUMF2-211ENST00000438133 A0A1B0GTH6 734 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 EML1O00423 815 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 GAS7O60861 476 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 COBLO75128 1261 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 FCER1AP12319 257 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 CCNA1P78396 465 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 SPAG1Q07617 926 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 EHHADHQ08426 723 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 NR1I3Q14994 352 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 TKFCQ3LXA3 575 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 POTEGQ6S5H5 508 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 ZNF592Q92610 1267 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 RIT2Q99578 217 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 MAF1Q9H063 256 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 DNM3Q9UQ16 869 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 RIPK3Q9Y572 518 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.64□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 BICDL2A1A5D9 508 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.63□□□□□ -0.07
SUMF2-211ENST00000438133 CNMDO75829 334 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms