RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 CXCL9Q07325 125 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 GINS2Q9Y248 185 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 PALMO75781 387 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 EGFRP00533 1210 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 GCLMP48507 274 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 HMGCS2P54868 508 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR59Q6PJI9 974 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 SAAL1Q96ER3 474 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 WRNIP1Q96S55 665 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC16A4O15374 487 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 SPDYE6P0CI01 402 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 PDIA5Q14554 519 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 HDXQ7Z353 690 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT12Q99456 494 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 NEFHP12036 1026 aa14.83□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC63Q05C16 580 aa14.83□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 IQCEQ6IPM2 695 aa14.83□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.83□□□□□ -0.03
RABGEF1-210ENST00000437078 VAV2P52735 878 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 BIRC3Q13489 604 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 DAAM2Q86T65 1068 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 GBP3Q9H0R5 595 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 M0R2N6 131 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 MYL1P05976 194 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFAIP3P21580 790 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 RMDN3Q96TC7 470 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 SH2D4AQ9H788 454 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 PARVGQ9HBI0 331 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 ZEB2O60315 1214 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 MICALL2Q8IY33 904 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 GUCY2DQ02846 1103 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 GBP6Q6ZN66 633 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 DPH5Q9H2P9 285 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 ESYT2A0FGR8 921 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R2P41236 205 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 CEP55Q53EZ4 464 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBED4O75132 1171 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP25P42331 645 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 CENPPQ6IPU0 288 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 PIM2Q9P1W9 311 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCA3Q99758 1704 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 SASH3O75995 380 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 MAP2K2P36507 400 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 MIIPQ5JXC2 388 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM58Q8NG06 486 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 USP11P51784 963 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 PADI6Q6TGC4 694 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 PEX26Q7Z412 305 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 NLRX1Q86UT6 975 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A087X0T9 212 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 ASNSP08243 561 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM228BP0C875 321 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 MARK3P27448 753 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 MAP9Q49MG5 647 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 TLDC2A0PJX2 215 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 HIP1RO75146 1068 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP1A2P50993 1020 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 CETN1Q12798 172 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 AP3B2Q13367 1082 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 MTERF2Q49AM1 385 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGEF1-210ENST00000437078 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms