RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 PAK2Q13177 524 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 UBE2SQ16763 222 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 NME8Q8N427 588 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 EXOC6Q8TAG9 804 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 MAP4K1Q92918 833 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 PBXIP1Q96AQ6 731 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 TMX1Q9H3N1 280 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC9A2Q9UBY0 812 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDHA6Q9UN73 950 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa17.09■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 WDFY4Q6ZS81 3184 aa17.08■□□□□ 0.33
ACTBP11-201ENST00000436287 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 SPDYE3A6NKU9 549 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 SGSM2O43147 1006 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 GATMP50440 423 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 ZXDAP98168 799 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PLCB4Q15147 1175 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 IER5LQ5T953 404 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 TMTC2Q8N394 836 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PRSS33Q8NF86 280 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PHOX2BQ99453 314 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 TLE6Q9H808 572 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNH7Q9NS40 1196 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 TRPC6Q9Y210 931 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 CACNA1HO95180 2353 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 C5orf42Q9H799 3197 aa17.08■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 SARSP49591 514 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 STAT5BP51692 787 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PTPN5P54829 565 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 ACTR2P61160 394 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 UBE3AQ05086 875 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 CASC1Q6TDU7 716 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PRRX2Q99811 253 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 MXRA8Q9BRK3 442 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 LRFN2Q9ULH4 789 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 DOCK5Q9H7D0 1870 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 NFASCO94856 1347 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PRC1O43663 620 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PPFIA3O75145 1194 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT76Q01546 638 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 MTHFD1LQ6UB35 978 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 NFXL1Q6ZNB6 911 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 CYP2W1Q8TAV3 490 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 ATP8B4Q8TF62 1192 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 KAT6AQ92794 2004 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC69A6NI79 296 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 ATG7O95352 703 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 CALM1P0DP23 149 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 CALM2P0DP24 149 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 CALM3P0DP25 149 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 RXRAP19793 462 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 MCM5P33992 734 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 LIFRP42702 1097 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM266Q2M3C6 531 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 FBXL6Q8N531 539 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 SUSD6Q92537 303 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM87BQ96K49 555 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 SDF4Q9BRK5 362 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 ERVK-5Q9HDB9 667 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 AAASQ9NRG9 546 aa17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 FSD2A1L4K1 749 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 PER2O15055 1255 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 MGEA5O60502 916 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 FGF18O76093 207 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 ARP10275 920 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 KLRC1P26715 233 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC26A2P50443 739 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 SIGLEC14Q08ET2 396 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 TCF15Q12870 199 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 DUSP6Q16828 381 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC24A5Q71RS6 500 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC82Q8N4S0 544 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 VN1R2Q8NFZ6 395 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 TLR9Q9NR96 1032 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 RGS18Q9NS28 235 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP11-201ENST00000436287 C1orf112Q9NSG2 853 aa17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms