RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LENG9Q96B70 501 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM167AQ96KS9 214 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GABBR1Q9UBS5 961 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GBF1Q92538 1859 aa18.35■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LARGE1O95461 756 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CTDNEP1O95476 244 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TDP2O95551 362 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GHRP10912 638 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGFBP4P22692 258 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT2P35908 639 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF484Q5JVG2 852 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MARCH8Q5T0T0 291 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MOXD1Q6UVY6 613 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEK8Q86SG6 692 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DISC1Q9NRI5 854 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.34■□□□□ 0.53
CDH23-AS1-201ENST00000428918 M0R2N6 131 aa18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DTNBO60941 627 aa18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHRNA1P02708 482 aa18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLRC1P26715 233 aa18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C8orf34Q49A92 452 aa18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MIER3Q7Z3K6 550 aa18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC5A5Q92911 643 aa18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.33■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TET1Q8NFU7 2136 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GJB5O95377 273 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CYP3A7P24462 503 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPY5RQ15761 445 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCTN1Q2MV58 587 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NME8Q8N427 588 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP38Q8NB14 1042 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAD9AQ99638 391 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.32■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOSBP53539 338 aa18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 METTL13Q8N6R0 699 aa18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RDM1Q8NG50 284 aa18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CERS4Q9HA82 394 aa18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GINS2Q9Y248 185 aa18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 INSL6Q9Y581 213 aa18.31■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 JAK2O60674 1132 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UPP2O95045 317 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OATP04181 439 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MGAT3Q09327 533 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LPIN1Q14693 890 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPM1EQ8WY54 764 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARNTL2Q8WYA1 636 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 YME1L1Q96TA2 773 aa18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAGEB2O15479 319 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSMD10O75832 226 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMOD1P28289 359 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRKCEQ02156 737 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAP1Q03518 808 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PAK2Q13177 524 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ODR4Q5SWX8 454 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OXER1Q8TDS5 423 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GJA10Q969M2 543 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM20AQ96MK3 541 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MBOAT7Q96N66 472 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAP7D2Q96T17 732 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SQORQ9Y6N5 450 aa18.29■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC37A4O43826 429 aa18.28■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EDIL3O43854 480 aa18.28■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ST18O60284 1047 aa18.28■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MMP1P03956 469 aa18.28■□□□□ 0.52
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP4AP20648 1035 aa18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms